【第一階段----牙周基本治療 (非手術治療)】

經過測量，初期的牙周病症狀，可在進行本階段治療時，即有痊癒的機會，最初的治療重點，區分為兩部分：硬組織及軟組織之清除。

硬組織部分的清除：
硬組織包括口腔內附著於牙齒表面附著物，牙結石。 清除方式包括全口超音波洗牙、牙周囊袋深部結石的刮除，以及牙根整平術。

軟組織部分的清除：
軟組織，包括發炎的牙肉組織及游離於牙周囊袋的細菌。

【第二階段----牙周進階手術手術治療】

牙周破壞較嚴重的牙周病患者，尤其是牙周囊袋較深之處，需做牙周翻瓣術，才能徹底將結石及病變組織清除。治療方式為在局部麻醉下，將牙齦稍微翻開，牙周深部的結石、肉牙組織徹底清除，若有骨損失，可配合放置「牙周再生膜」及「人工骨粉」，使破壞的骨組織再生，達到積極重建牙周組織的目的。

【第三階段----牙周保養期】

牙周治療完成後，維持成果是極重要的。因為我們每天都需要喝水進食交談，口腔內很容易再造成細菌生成。所以除了要持續保持口腔清潔的良好習慣外，應依醫師指示，定期回診檢查，以充分掌握牙周及口腔情況。